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首页 > 商务会议 > 生物/医学会议 > 16S微生物宏基因组与宏转录组学数据分析实操班12月南京 更新时间:2020-11-12T11:24:26

16S微生物宏基因组与宏转录组学数据分析实操班12月南京
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16S微生物宏基因组与宏转录组学数据分析实操班12月南京 已过期
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会议时间:2020-12-10 09:00至 2020-12-13 18:00结束

会议地点: 南京  详细地址会前通知  

会议规模:30人

主办单位: 中科成创(北京)生物技术有限公司

发票类型:增值税普通发票 增值税普通发票
领取方式:会后快递 现场领取 
发票内容: 会议费 会务费 会议服务费 会议展览服务费 会议注册费 注册费 咨询费 技术服务费 培训费 技术培训费 信息服务费 资料费 服务费 
参会凭证:邮件/短信发送参会通知 现场凭电话姓名参会

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        会议通知

        会议内容 主办方介绍


        16S微生物宏基因组与宏转录组学数据分析实操班12月南京

        16S微生物宏基因组与宏转录组学数据分析实操班12月南京宣传图

        微生物基因组学及后期数据分析专题培训班”的通知
        各有关单位:

        一、培训目标及特点:
        本培训以微生物宏基因组学技术的应用与数据分析为主题,精心设计了具有前沿性、实用性和针对性强的理论课程和上机课程。培训邀请的主讲人均是有理论和实际研究经验的人员。学员通过与专家直接交流,能够分享到这些顶尖学术机构的研究经验和实验设计思路。学员通过集中专题学习后能够扩展思路,在研究技术方面领悟更多。

        二、授课专家:
        主讲专家来自中科院科研机构的高级专家,拥有丰富的科研工作经验,长期从事生物信息学方面的项目研究,发表Nature, Nature Cell Biology, Molecular Cell等杂志40多篇。具有资深的技术底蕴和专业背景,目前承担国家科技部、国家自然基金委和市科技新星项目等多项课题。


        三、时间地点:        2020年12月10日——12月13日   江苏  南京
                                        (时间安排:第1天报到,授课3天)


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        中科成创(北京)生物技术有限公司

        主要经营生物技术开发、技术咨询、技术服务、技术转让、技术推广;货物进出口;技术进出口;代理进出口;会议服务;承办展览展示活动;组织文化艺术交流活动(不含演出);餐饮管理;体育运动项目经营(高危险性项目除外);票务代理(不含航空机票销售代理);销售办公用品、工艺品、珠宝首饰、日用品、服装、鞋帽、针纺织品、体育用品、家用电器、电子产品、计算机、软件及辅助设备。

        会议日程

        (最终日程以会议现场为准)


        四、培训内容:

        (12月11日  上午)

        微生物基因组

        微生物基因组和转录组学研究

        1.1、微生物基因组研究的意义

        1.2、微生物基因组研究概况

        1.3、微生物基因组的特点

        1.4、微生物转录组学研究


        (12月11日 下午)

        R语言绘图

        1.1 R语言基本介绍

        1.2 R语言基本运算、向量函数

        1.3 R语言数据读入以及导出

        ggplot2基本绘图 (条形图、散点图、折线图等)


        (12月12日 上午)

        宏基因组学

        1. 16S rDNA AMPLICON SEQUENCING 法

        1.1. 测序平台、引物设计及区域选择不同测序平台、针对细菌、真菌不同微生物实验设计

        1.2. 测序量及采样建议

        针对水体、粪便、土壤、物体表面、口腔等不同生境

        1.3. 分析流程图

        数据收集、数据预处理、数据分析

        1.4. 结果解析

        1.4.1 OTU聚类

        1.4.2 物种注释

        1.4.3 物种分布情况

        1.4.4 样品复杂度分析:α多样性

        Coverage   Chao指数   ACE指数

        Shannon曲线

        Richness rarefaction曲线

        1.4.5 多样品比较分析:β多样性

        样品间物种丰度热图

        排序分析:

        PCA分析

        PCoA分析

        NMDS分析

        Unifrac分析

        样品聚类分析

        2. DSS (direct shotgun sequencing)法

        2.1. 分析流程

        2.2. 功能注释分析

        2.3. 代谢途径解析


        (12月12日  下午)

        微生物基因组及宏转录组常用软件介绍

        2.1 微生物基因组在线圈图分析

        2.2 代谢通路分析(KEGG & KAAS)

        2.3 病原菌耐药基因鉴定(CARD & Resfinder)

        2.4 细菌基因组岛鉴定 (Islandviewer)

        2.5 CAZy 碳水化合物活性酶注释(宏转录组)

        2.6 基因差异表达分析(宏转录组)

        2.7 基因聚类分析(宏转录组)


        (12月13日  上午)

        宏转录组学

        1 宏转录组学介绍

        2 宏转录组学定义

        3 宏转录组研究方法

        4 宏转录组研究内容

        5 宏基因组与宏转录组的差别



        (12月13日  下午)

        16S测序数据分析及宏基因组学软件介绍

        1. 笔记本电脑配置要求建议笔记本内存4G以上,64位操作系统

        2. 针对16S rDNA amplicon sequencing分析

        2.1. 虚拟机安装:Virtual Box

        2.2. 16S分析运行环境搭建:QIIME Virtual Machine


        2.3. 实例演示及结果展示

        数据预处理

        OTU 聚类

        物种注释

        OTU table生成

        α多样性分析

        序列比对

        构建进化树

        β多样性分析


        3. 针对shotgun sequencing分析(只做流程演示讲解)

        3.1. 序列质量控制:fastqc

        3.2. 序列拼接

        3.3. 基因预测及丰度分析

        3.4. 物种注释

        3.4. 功能注释

        3.5. MetaSPAdes、MEGAN、metAMOS等软件介绍

        (*实际授课还会增加一些学员报名时反馈的感兴趣内容,希望参会人员可以把自己想了解的内容,报名时一起填写在回执表上。大家在上课期间有什么问题,都可以随时提出,如果有针对性问题可在 课间、课下和老师进行交流;)

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        会议嘉宾


        即将更新,敬请期待

        参会指南

        会议门票


        五、报名办法及费用:  
        每人¥3980元(含报名费、培训费、资料费、上机费)
        团队报名:4+1优惠。(5位其中1位免除费用)
        食宿可统一安排,费用自理。各单位人员报名参加,报名回执表请回传至会务处即可。
        如单位有内训需求,请将内训方案传至会务组,根据单位需求安排相应专家进行授课

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        温馨提示
        酒店与住宿: 为防止极端情况下活动延期或取消,建议“异地客户”与活动家客服确认参会信息后,再安排出行与住宿。
        退款规则: 活动各项资源需提前采购,购票后不支持退款,可以换人参加。

        标签: 微生物 基因组

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        活动家为本会议官方合作
        报名平台,您可在线购票

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