分子动力学模拟与Gromacs应用研讨会

2025年7月19-20日 腾讯会议网络会议室

课程背景：

在当今科学研究中，计算机仿真技术构建起了理论与实验研究之间的桥梁。这种数值模拟手段不仅能解译实验观测数据、验证理论模型的有效性，更在分子科学领域开创了独特的认知维度：通过建立原子层面的动态模型，研究者可突破传统研究方法的局限，系统性培养多维分析能力，其思维模式在持续实践中将实现质的跃迁，最终形成对复杂科学问题的穿透式理解。

在众多分子模拟技术中，分子动力学方法因其与实验研究的互补特性备受关注。该方法通过建立原子运动方程，精确再现纳米尺度下的物质演化轨迹，为揭示生物分子互作机制、解析新型材料性能本源提供定量研究工具。以新药研发为例，科学家通过模拟药物分子与靶标蛋白的结合过程，可提前预判候选化合物的有效性，显著提升研发效率。这种"数字实验室"的独特价值，使其在生命科学、药物研发等前沿领域获得广泛应用。

作为分子动力学领域的标杆工具，GROMACS凭借其卓越性能构建了显著竞争优势。该开源软件不仅整合了涵盖生物大分子与有机化合物的多样化力场参数库，其模块化架构更能适应从溶液环境到固态材料的多场景建模需求。技术特色方面，开发者精心集成了超过200种分析算法，有效解决了传统模拟工作中数据处理效率低下的痛点。更值得关注的是其底层优化带来的运算速度优势：在同等硬件条件下，GROMACS的计算效率较同类软件提升30%-50%，这对需要海量重复计算的自由能计算等研究神秘嘉宾重要。正是这些技术优势与活跃的开发者社区支持，使其用户群体持续增长。

学习目标：

本课程将系统讲解Gromacs软件在生物医学领域中的具体应用，精心选取各种实际案例进行实战演练，并分散难点。您将学会：

365364. 应用Gromacs软件进行单体蛋白、蛋白-蛋白复合物、蛋白-蛋白-金属离子复合物、蛋白-小分子复合物、DNA的分子动力学模拟和分析
365364. 在本地电脑和云服务器上进行分子动力学模拟

适合对象： 各级医院临床医生、药师、科研单位研究人员、高校老师、硕/博士研究生、对计算机辅助药物设计感兴趣的广大师生（尤其适合初学者和无基础的学员，无需任何基础，也无需学习任何编程语言）。

课程特色：

本学习班全程在线电脑实战教学，90%以上为上机指导操作，无繁琐的理论授课。建立专属班级交流平台，学员学完后可以继续在班级群与老师同学交流问题，巩固学习内容。

会议时间：2025年7月19-20日，上午8:30-12:00，下午14:00-17:30

会议地点：腾讯会议网络会议室

主办单位：上海统循会务咨询有限公司

收费标准：

2800元/人。与AlphaFold3与ChatGPT辅助药物设计2天班一起报收费4800元/人。

优惠措施：提前报名并付费可以提前拿到学习资料

3人组团，每人优惠100元，4人组团，每人优惠200元

6人组团，可免一人注册费（即只交5个人的费用）

注意事项：所有资料均为电子版，会后主办方提供全程录屏作为复习资料