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上海市儿科医学研究所是上海市第一所以研究儿童生长发育、儿科疾病为重点，兼有医疗、教学和预防任务的应用医学研究机构。现任所长：蔡威教授。目前设有小儿内分泌/遗传代谢病、细胞遗传、免疫/肿瘤、儿童保健/环境医学、围产医学、新生儿外科以及消化营养等研究室，拥有生物化学、分子生物、细胞、免疫等技术平台。进入二十一世纪以来，以出生缺陷的早期诊断和治疗为研究重点。
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